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1.行星撞擊理論:銥(Iridium)在地球上含量很少, 但在白堊紀的沉積物中發現了豐富份量, 使人猜想乃行星撞擊所留下證據。估計當時因撞擊而引起地表上濃密而蔽日的塵埃, 擋住了陽光而使大量植物枯死, 地球氣候寒冷, 素食恐龍因食物鏈中斷而滅亡; 肉食恐龍最後亦步其後塵, 當時即使能有絕少數小型的恐龍, 但不久亦難以倖免。
2.火山爆發理論: 白堊紀未期火山頻密活動帶來慢性災害, 大量的火山灰噴發出來, 經常把成群的古生物淹沒, (孔子鳥的形成可能其中之一), 大氣層逐漸昏暗, 植物枯萎, 動物亦相互獵殺而同歸滅亡。
3.哺乳類動物的出現: 到了白堊紀未期, 素食恐龍被肉食恐龍吃盡之後, 祇好相互殘殺, 同時小型哺乳類動物亦因為過度饑荒, 冒險盜取恐龍的卵, 并藉此為生。恐龍的後代受到嚴重威脅, 更有人猜測當時恐龍種族中發生了流行瘟疫, 有毒氣體漫延; 植物受污染而毒化, 最後完全滅亡。