孙中山故居位于翠亨村后边缘，座东朝西，占地面积500平方米，其中建筑面积340平方米。故居的主体建筑，是孙中山于1892年3月亲自主持建造的一座赭红色二层小楼。它的前院北侧是当年孙中山出生的房舍旧址，南侧有孙中山栽种的一棵酸子树。
这座融合了中、西建筑特点的两层楼房，首层居中是客厅，后面是孙中山母亲的卧室。两侧分别是孙中山和其大哥孙眉的房间。二楼中间与首层客厅顶部贯通，两侧分别是孙中山的书房和客房。 楼房正面，上下层各有由七个圆拱装饰的走廊。整个建筑是砖木结构。内墙四壁粉刷成灰色，并用石灰勾画出白色的砖缝线。该建筑物门多、窗多，外墙的窗全部在玻璃窗外加了一层木制百叶窗，既可遮挡雨水、阳光，又可通风透气。而十多个门和南北两侧的楼梯，即为今天疏导成千上万的观众带来了方便。
故居室内陈设保持着1892年至1895年间孙中山先生经常返乡居住时的景貌。孙中山先生最后一次在此小住是1912年5月。1934年，孙中山先生的亲属把这所房子交付给当时的国民政府管理。1938年至1955年，孙中山之姐孙妙茜曾断续在此居住并负责管理。1955年孙妙茜去世，1956年成立孙中山故居纪念馆。孙中山故居的西侧和南侧过去是树林和农田，现已开辟为公园供游人休憩。